Afrodit Tapınağı, antik dünyanın en dikkat çekici yapılarından biri olarak, tarih boyunca farklı dönemlerin izlerini taşımaktadır. İon düzeninde inşa edilen bu mermer yapı, hem mimari hem de kültürel açıdan önem arz etmektedir. Zamanla geçirdiği dönüşümler, tapınağın sadece bir ibadet yeri olmanın ötesine geçerek, Anadolu'nun tarihi ve sosyal yapısı hakkında da önemli bilgiler sunmaktadır.

Afrodit Tapınağı'nın tarihi şu şekilde özetlenebilir:

• Arkaik dönem. Tapınağın ilk yapımının Arkaik döneme kadar gittiği belirtilse de, bu ifade dikkatli ele alınmalıdır. Tapınağın altında yapılan araştırmalarda Arkaik döneme ait seramikler, erken yapı izleri ve Helenistik döneme ait bazı kalıntılar bulunmuştur.
• MÖ 30’lu yıllar. Tapınağın ilk büyük inşa evresi, Gaius Julius Zoilos’un katkısıyla başlamıştır.
• MÖ 1. yüzyıl sonları. Tapınak, bu dönemde anıtsal kimliğine kavuşmuştur.
• MS 5. yüzyıl. Tapınak, Hristiyanlığın yayılmasıyla birlikte bazilikaya dönüştürülmüştür.

Afrodit Tapınağı, Anadolu’ya özgü İon düzeninde, tamamen mermerden inşa edilmiş bir yapıdır.